- Отделение № 1 для больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя, в том числе для ВИЧ-инфицированных
- Отделение № 2 туберкулёзное легочно-хирургическое, в том числе для ВИЧ-инфицированных
- Отделение № 3 дифференциально-диагностическое, в том числе для ВИЧ-инфицированных
- Отделение № 4 для больных туберкулезом внелегочной локализации (для больных с активными формами туберкулеза костей и суставов, урогенитальным туберкулезом и заболеваниями урологического и гинекологического профиля, абдоминальным туберкулезом, туберкулезом периферических лимфатических узлов, общехирургическая помощь для больных активным туберкулезом), в том числе для ВИЧ-инфицированных
- Отделение № 5 для больных туберкулезом, сочетанным с ВИЧ -инфекцией
- Отделение № 6 для больных туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью возбудителя, в том числе для ВИЧ-инфицированных больных с туберкулезным менингитом
- Отделение № 7 для больных туберкулезом органов дыхания с бактериовыделением
- Отделение анестезиологии и реанимации
Вспомогательные отделения: